La pluie était prévue et elle s’est bel et bien invitée sur le tracé du Sachsenring pour venir se mêler aux hostilités de la course MotoGP. Elle s’est même intensifiée quelques minutes avant le départ. C’est donc très logiquement que la course a été déclarée « Wet » avec la possibilité de s’arrêter pour changer de moto durant la course.
Depuis la pole position, sa septième sur ce tracé, Marc Marquez cherche à remporter sa septième victoire consécutive au Sachsenring. Si Marquez souhaitait une température moins élevée pour la course hier soir durant la conférence de presse, Rossi espérait les mêmes conditions que samedi. Malheureusement, la pluie et le froid viennent changer la donne au départ de la course. À noter que Honda domine le Grand Prix d’Allemagne depuis 2010. La dernière victoire Yamaha remonte à 2009 et la victoire de Valentino Rossi.
La pluie s’arrête juste avant le départ de la course. Les 14 pilotes optent alors en majorité pour le pneu avant extra-tendre au départ à l’image de Rossi, Marquez ou encore Lorenzo et Pedrosa. Ce pneu a été essayé pour la première fois durant le warm-up ce matin et a été apprécié par l’ensemble du plateau.
Marquez réalise le holeshot devant Rossi et Petrucci qui surgit en troisième position au second virage avant d’être doublé par Dovizioso. Alors que Rossi prend la tête, Dovizioso et Petrucci prennent l’avantage sur Marquez. Lorenzo est relégué en 11e position.
Rossi et Dovizioso tentent de creuser l’écart, mais Petrucci et Marquez restent au contact. Miller, vainqueur à Assen dans ces mêmes conditions, complète le Top 5 derrière Marquez et devant Barbera. À noter que Loris Baz, qui espérait la pluie hier soir, occupe la 16e place.
Petrucci, maitre sous le mouillé, prend le commandement de la course sur Dovizioso et Rossi. À noter que Petrucci fait partie de ceux ayant opté pour le pneu tendre avant. Marquez s’incline en 5e position derrière Miller qui tente combler l’écart sur le groupe de tête.
Petrucci chute au virage #3 et laisse le champ libre à Dovizioso devant Rossi à 20 tours de l’arrivée. Derrière, Marquez sort de piste et évite la chute.
Peu avant la mi-course, la piste laisse transparaitre une trajectoire séchante. Iannone lance la série des arrêts au box et en profite pour repartir en Intermédiaires. Baz opte pour un slick arrière alors que les autres équipes préparent les deuxièmes machines.
Marquez fait un arrêt à 13 tours de l’arrivée et fait le pari de sortir en slick avant et arrière. Dovizioso maintient son écart en tête devant Rossi, Barbera, Crutchlow et Miller. Cette valse des arrêts profite à Lorenzo qui remonte en 9e position.
Alors que Rossi est panneauté pour s’arrêter, il persiste (comme l’an dernier à Misano) en restant dans la roue de Dovizioso en 2e position. Barbera et Cruchlow s’échangent la place pour une troisième place sur le podium. Pendant ce temps, Marquez est le plus rapide en piste en 1’28 contre 1’35 pour Dovizioso. Il faudra attendre les sept derniers tours pour que Rossi, Dovizioso, Barbera et Cructchlow prennent le choix de s’arrêter. Miller continue et prend la tête. Rossi repart en Intermédiaires.
Marquez tourne alors près de 10 secondes plus vite que Miller et s’empare du commandement de la course. Redding, Dovizioso, Crutchlow et Miller composent alors le Top 5 à quatre tours du drapeau à damier.
Grâce à une stratégie osée mais parfaite, Marquez se fraye finalement un chemin vers la victoire devant un Crutchlow auteur d’une superbe remontée, et un Dovizioso qui signe le 100e podium Ducati en MotoGP.
Redding échoue au pied du podium devant Iannone, Pedrosa, Miller et Rossi. Lorenzo marque le point de la 15e place. Baz termine en 17e position.
| Pos. | Num. | Pilote | Pays | Team | Moto | Km/h | Ecarts | |
| 1 | 93 | Marc MARQUEZ | SPA | Repsol Honda Team | Honda | 140.4 | ||
| 2 | 35 | Cal CRUTCHLOW | GBR | LCR Honda | Honda | 139.9 | +9.857 | |
| 3 | 4 | Andrea DOVIZIOSO | ITA | Ducati Team | Ducati | 139.8 | +11.613 | |
| 4 | 45 | Scott REDDING | GBR | OCTO Pramac Yakhnich | Ducati | 139.8 | +11.992 | |
| 5 | 29 | Andrea IANNONE | ITA | Ducati Team | Ducati | 139.3 | +22.755 | |
| 6 | 26 | Dani PEDROSA | SPA | Repsol Honda Team | Honda | 139.1 | +25.920 | |
| 7 | 43 | Jack MILLER | AUS | Estrella Galicia 0,0 Marc VDS | Honda | 139.1 | +26.043 | |
| 8 | 46 | Valentino ROSSI | ITA | Movistar Yamaha MotoGP | Yamaha | 139.1 | +26.449 | |
| 9 | 8 | Hector BARBERA | SPA | Avintia Racing | Ducati | 139.1 | +26.614 | |
| 10 | 19 | Alvaro BAUTISTA | SPA | Aprilia Racing Team Gresini | Aprilia | 138.8 | +31.274 | |
| 11 | 50 | Eugene LAVERTY | IRL | Pull & Bear Aspar Team | Ducati | 138.4 | +41.208 | |
| 12 | 25 | Maverick VIÑALES | SPA | Team SUZUKI ECSTAR | Suzuki | 138.3 | +42.158 | |
| 13 | 38 | Bradley SMITH | GBR | Monster Yamaha Tech 3 | Yamaha | 137.3 | +1’03.129 | |
| 14 | 41 | Aleix ESPARGARO | SPA | Team SUZUKI ECSTAR | Suzuki | 137.2 | +1’06.091 | |
| 15 | 99 | Jorge LORENZO | SPA | Movistar Yamaha MotoGP | Yamaha | 136.6 | +1’17.694 | |
| 16 | 53 | Tito RABAT | SPA | Estrella Galicia 0,0 Marc VDS | Honda | 133.5 | 1 Tour | |
| 17 | 76 | Loris BAZ | FRA | Avintia Racing | Ducati | 128.3 | 2 Tours | |
| 18 | 68 | Yonny HERNANDEZ | COL | Pull & Bear Aspar Team | Ducati | 125.1 | 3 Tours | |
| Non classés | ||||||||
| 44 | Pol ESPARGARO | SPA | Monster Yamaha Tech 3 | Yamaha | 137.5 | 13 Tours | ||
| 9 | Danilo PETRUCCI | ITA | OCTO Pramac Yakhnich | Ducati | 126.4 | 18 Tours | ||
Au championnat, Marc Marquez double son avance sur Jorge Lorenzo tandis que Valentino Rossi concède maintenant 59 points:
| Pos. | Pilote | Moto | Pays | Points |
| 1 | Marc MARQUEZ | Honda | SPA | 170 |
| 2 | Jorge LORENZO | Yamaha | SPA | 122 |
| 3 | Valentino ROSSI | Yamaha | ITA | 111 |
| 4 | Dani PEDROSA | Honda | SPA | 96 |
| 5 | Maverick VIÑALES | Suzuki | SPA | 83 |
| 6 | Pol ESPARGARO | Yamaha | SPA | 72 |
| 7 | Hector BARBERA | Ducati | SPA | 65 |
| 8 | Andrea IANNONE | Ducati | ITA | 63 |
| 9 | Andrea DOVIZIOSO | Ducati | ITA | 59 |
| 10 | Eugene LAVERTY | Ducati | IRL | 53 |
| 11 | Aleix ESPARGARO | Suzuki | SPA | 51 |
| 12 | Scott REDDING | Ducati | GBR | 45 |
| 13 | Jack MILLER | Honda | AUS | 42 |
| 14 | Cal CRUTCHLOW | Honda | GBR | 40 |
| 15 | Stefan BRADL | Aprilia | GER | 37 |
| 16 | Bradley SMITH | Yamaha | GBR | 35 |
| 17 | Alvaro BAUTISTA | Aprilia | SPA | 35 |
| 18 | Danilo PETRUCCI | Ducati | ITA | 24 |
| 19 | Michele PIRRO | Ducati | ITA | 19 |
| 20 | Tito RABAT | Honda | SPA | 18 |
| 21 | Loris BAZ | Ducati | FRA | 8 |
| 22 | Yonny HERNANDEZ | Ducati | COL | 3 |
